Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GP1BBP13224 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GP1BBP13224 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GP1BBP13224 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GP1BBP13224 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GP1BBP13224 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GP1BBP13224 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GP1BBP13224 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GP1BBP13224 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GP1BBP13224 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GP1BBP13224 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GP1BBP13224 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GP1BBP13224 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GP1BBP13224 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GP1BBP13224 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GP1BBP13224 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GP1BBP13224 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GP1BBP13224 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GP1BBP13224 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GP1BBP13224 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GP1BBP13224 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GP1BBP13224 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GP1BBP13224 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GP1BBP13224 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GP1BBP13224 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GP1BBP13224 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GP1BBP13224 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GP1BBP13224 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GP1BBP13224 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GP1BBP13224 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GP1BBP13224 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GP1BBP13224 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GP1BBP13224 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GP1BBP13224 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GP1BBP13224 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GP1BBP13224 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GP1BBP13224 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GP1BBP13224 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GP1BBP13224 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GP1BBP13224 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GP1BBP13224 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GP1BBP13224 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GP1BBP13224 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GP1BBP13224 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GP1BBP13224 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GP1BBP13224 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GP1BBP13224 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GP1BBP13224 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GP1BBP13224 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GP1BBP13224 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GP1BBP13224 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GP1BBP13224 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GP1BBP13224 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GP1BBP13224 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GP1BBP13224 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GP1BBP13224 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GP1BBP13224 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GP1BBP13224 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GP1BBP13224 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GP1BBP13224 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GP1BBP13224 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GP1BBP13224 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GP1BBP13224 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GP1BBP13224 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GP1BBP13224 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GP1BBP13224 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GP1BBP13224 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GP1BBP13224 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GP1BBP13224 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GP1BBP13224 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GP1BBP13224 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GP1BBP13224 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GP1BBP13224 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GP1BBP13224 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GP1BBP13224 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GP1BBP13224 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GP1BBP13224 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GP1BBP13224 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GP1BBP13224 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GP1BBP13224 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GP1BBP13224 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GP1BBP13224 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GP1BBP13224 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GP1BBP13224 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GP1BBP13224 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GP1BBP13224 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GP1BBP13224 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GP1BBP13224 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GP1BBP13224 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GP1BBP13224 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GP1BBP13224 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GP1BBP13224 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GP1BBP13224 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GP1BBP13224 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GP1BBP13224 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GP1BBP13224 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GP1BBP13224 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GP1BBP13224 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GP1BBP13224 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GP1BBP13224 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms