Protein–RNA interactions for Protein: P12270

TPR, Nucleoprotein TPR, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRP12270 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPRP12270 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPRP12270 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPRP12270 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPRP12270 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPRP12270 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TPRP12270 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPRP12270 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPRP12270 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPRP12270 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPRP12270 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPRP12270 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPRP12270 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPRP12270 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TPRP12270 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPRP12270 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPRP12270 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPRP12270 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPRP12270 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPRP12270 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPRP12270 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPRP12270 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPRP12270 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPRP12270 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPRP12270 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPRP12270 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPRP12270 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TPRP12270 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TPRP12270 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPRP12270 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPRP12270 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPRP12270 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPRP12270 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPRP12270 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPRP12270 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPRP12270 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPRP12270 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPRP12270 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPRP12270 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPRP12270 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPRP12270 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TPRP12270 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPRP12270 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPRP12270 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPRP12270 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPRP12270 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPRP12270 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPRP12270 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPRP12270 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TPRP12270 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TPRP12270 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TPRP12270 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPRP12270 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TPRP12270 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPRP12270 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPRP12270 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
TPRP12270 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TPRP12270 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TPRP12270 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TPRP12270 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPRP12270 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPRP12270 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPRP12270 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPRP12270 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPRP12270 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPRP12270 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPRP12270 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPRP12270 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TPRP12270 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPRP12270 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPRP12270 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPRP12270 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPRP12270 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPRP12270 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPRP12270 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TPRP12270 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPRP12270 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPRP12270 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPRP12270 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPRP12270 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPRP12270 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TPRP12270 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TPRP12270 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TPRP12270 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TPRP12270 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPRP12270 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPRP12270 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPRP12270 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPRP12270 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPRP12270 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPRP12270 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPRP12270 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPRP12270 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPRP12270 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPRP12270 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TPRP12270 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPRP12270 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPRP12270 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPRP12270 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPRP12270 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms