Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TOP1P11387 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TOP1P11387 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TOP1P11387 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TOP1P11387 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TOP1P11387 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TOP1P11387 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TOP1P11387 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TOP1P11387 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TOP1P11387 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TOP1P11387 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TOP1P11387 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TOP1P11387 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TOP1P11387 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TOP1P11387 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TOP1P11387 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TOP1P11387 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TOP1P11387 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TOP1P11387 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TOP1P11387 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TOP1P11387 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TOP1P11387 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TOP1P11387 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TOP1P11387 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TOP1P11387 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TOP1P11387 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TOP1P11387 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TOP1P11387 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TOP1P11387 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
TOP1P11387 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TOP1P11387 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TOP1P11387 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TOP1P11387 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TOP1P11387 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TOP1P11387 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TOP1P11387 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
TOP1P11387 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TOP1P11387 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
TOP1P11387 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TOP1P11387 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TOP1P11387 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TOP1P11387 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TOP1P11387 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TOP1P11387 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TOP1P11387 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TOP1P11387 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TOP1P11387 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TOP1P11387 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TOP1P11387 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TOP1P11387 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TOP1P11387 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TOP1P11387 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TOP1P11387 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TOP1P11387 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TOP1P11387 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TOP1P11387 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TOP1P11387 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TOP1P11387 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TOP1P11387 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TOP1P11387 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TOP1P11387 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TOP1P11387 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TOP1P11387 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TOP1P11387 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TOP1P11387 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TOP1P11387 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TOP1P11387 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TOP1P11387 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TOP1P11387 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TOP1P11387 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TOP1P11387 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TOP1P11387 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TOP1P11387 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TOP1P11387 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TOP1P11387 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TOP1P11387 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TOP1P11387 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TOP1P11387 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TOP1P11387 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.12
TOP1P11387 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TOP1P11387 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TOP1P11387 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TOP1P11387 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TOP1P11387 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TOP1P11387 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TOP1P11387 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TOP1P11387 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TOP1P11387 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TOP1P11387 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TOP1P11387 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TOP1P11387 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TOP1P11387 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TOP1P11387 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TOP1P11387 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TOP1P11387 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TOP1P11387 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TOP1P11387 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TOP1P11387 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TOP1P11387 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TOP1P11387 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms