Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
LAMC1P11047 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC34.79■■■■□ 3.16
LAMC1P11047 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
LAMC1P11047 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
LAMC1P11047 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
LAMC1P11047 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
LAMC1P11047 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
LAMC1P11047 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
LAMC1P11047 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
LAMC1P11047 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
LAMC1P11047 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
LAMC1P11047 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
LAMC1P11047 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
LAMC1P11047 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
LAMC1P11047 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
LAMC1P11047 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.15
LAMC1P11047 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC34.76■■■■□ 3.15
LAMC1P11047 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
LAMC1P11047 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
LAMC1P11047 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
LAMC1P11047 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
LAMC1P11047 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
LAMC1P11047 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
LAMC1P11047 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
LAMC1P11047 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
LAMC1P11047 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
LAMC1P11047 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
LAMC1P11047 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
LAMC1P11047 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
LAMC1P11047 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
LAMC1P11047 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
LAMC1P11047 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
LAMC1P11047 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
LAMC1P11047 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
LAMC1P11047 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
LAMC1P11047 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
LAMC1P11047 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
LAMC1P11047 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
LAMC1P11047 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
LAMC1P11047 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
LAMC1P11047 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
LAMC1P11047 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
LAMC1P11047 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.14
LAMC1P11047 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.14
LAMC1P11047 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
LAMC1P11047 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
LAMC1P11047 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
LAMC1P11047 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
LAMC1P11047 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
LAMC1P11047 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
LAMC1P11047 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
LAMC1P11047 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
LAMC1P11047 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
LAMC1P11047 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
LAMC1P11047 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
LAMC1P11047 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
LAMC1P11047 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
LAMC1P11047 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
LAMC1P11047 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
LAMC1P11047 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
LAMC1P11047 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
LAMC1P11047 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
LAMC1P11047 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
LAMC1P11047 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
LAMC1P11047 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
LAMC1P11047 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
LAMC1P11047 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
LAMC1P11047 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
LAMC1P11047 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
LAMC1P11047 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
LAMC1P11047 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
LAMC1P11047 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
LAMC1P11047 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
LAMC1P11047 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
LAMC1P11047 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
LAMC1P11047 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
LAMC1P11047 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
LAMC1P11047 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
LAMC1P11047 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
LAMC1P11047 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
LAMC1P11047 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
LAMC1P11047 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
LAMC1P11047 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
LAMC1P11047 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC34.6■■■■□ 3.13
LAMC1P11047 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
LAMC1P11047 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
LAMC1P11047 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC34.59■■■■□ 3.13
LAMC1P11047 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC34.59■■■■□ 3.13
LAMC1P11047 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC34.59■■■■□ 3.13
LAMC1P11047 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
LAMC1P11047 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
LAMC1P11047 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
LAMC1P11047 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
LAMC1P11047 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
LAMC1P11047 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
LAMC1P11047 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
LAMC1P11047 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC34.58■■■■□ 3.13
LAMC1P11047 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
LAMC1P11047 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
LAMC1P11047 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms