Protein–RNA interactions for Protein: P0DML3

CSH2, Chorionic somatomammotropin hormone 2, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSH2P0DML3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CSH2P0DML3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CSH2P0DML3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CSH2P0DML3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CSH2P0DML3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSH2P0DML3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSH2P0DML3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSH2P0DML3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSH2P0DML3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSH2P0DML3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSH2P0DML3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSH2P0DML3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSH2P0DML3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CSH2P0DML3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CSH2P0DML3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CSH2P0DML3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CSH2P0DML3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CSH2P0DML3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CSH2P0DML3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CSH2P0DML3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CSH2P0DML3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CSH2P0DML3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CSH2P0DML3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CSH2P0DML3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CSH2P0DML3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CSH2P0DML3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CSH2P0DML3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CSH2P0DML3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CSH2P0DML3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CSH2P0DML3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CSH2P0DML3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CSH2P0DML3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CSH2P0DML3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CSH2P0DML3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CSH2P0DML3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CSH2P0DML3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CSH2P0DML3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CSH2P0DML3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CSH2P0DML3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSH2P0DML3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSH2P0DML3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSH2P0DML3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSH2P0DML3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSH2P0DML3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSH2P0DML3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSH2P0DML3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSH2P0DML3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSH2P0DML3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSH2P0DML3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSH2P0DML3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSH2P0DML3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CSH2P0DML3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CSH2P0DML3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CSH2P0DML3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CSH2P0DML3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CSH2P0DML3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CSH2P0DML3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CSH2P0DML3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CSH2P0DML3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CSH2P0DML3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CSH2P0DML3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CSH2P0DML3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CSH2P0DML3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSH2P0DML3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSH2P0DML3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSH2P0DML3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSH2P0DML3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSH2P0DML3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSH2P0DML3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSH2P0DML3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSH2P0DML3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSH2P0DML3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSH2P0DML3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CSH2P0DML3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSH2P0DML3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSH2P0DML3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSH2P0DML3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSH2P0DML3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSH2P0DML3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSH2P0DML3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSH2P0DML3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSH2P0DML3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSH2P0DML3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSH2P0DML3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSH2P0DML3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSH2P0DML3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSH2P0DML3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSH2P0DML3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSH2P0DML3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSH2P0DML3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSH2P0DML3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSH2P0DML3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSH2P0DML3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSH2P0DML3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSH2P0DML3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSH2P0DML3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSH2P0DML3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSH2P0DML3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSH2P0DML3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSH2P0DML3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms