Protein–RNA interactions for Protein: P08962

CD63, CD63 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD63P08962 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD63P08962 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD63P08962 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD63P08962 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD63P08962 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD63P08962 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD63P08962 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD63P08962 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD63P08962 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD63P08962 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD63P08962 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD63P08962 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD63P08962 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD63P08962 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD63P08962 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD63P08962 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD63P08962 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CD63P08962 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD63P08962 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD63P08962 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD63P08962 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD63P08962 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD63P08962 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD63P08962 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CD63P08962 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD63P08962 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD63P08962 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD63P08962 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CD63P08962 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CD63P08962 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CD63P08962 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD63P08962 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD63P08962 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD63P08962 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD63P08962 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD63P08962 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD63P08962 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD63P08962 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CD63P08962 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CD63P08962 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD63P08962 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD63P08962 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD63P08962 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD63P08962 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD63P08962 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD63P08962 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD63P08962 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD63P08962 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD63P08962 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD63P08962 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CD63P08962 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD63P08962 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD63P08962 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD63P08962 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD63P08962 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD63P08962 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD63P08962 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD63P08962 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD63P08962 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD63P08962 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD63P08962 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD63P08962 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD63P08962 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CD63P08962 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD63P08962 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD63P08962 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD63P08962 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD63P08962 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD63P08962 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD63P08962 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD63P08962 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CD63P08962 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD63P08962 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD63P08962 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD63P08962 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD63P08962 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD63P08962 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD63P08962 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD63P08962 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD63P08962 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD63P08962 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CD63P08962 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD63P08962 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CD63P08962 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD63P08962 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD63P08962 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD63P08962 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD63P08962 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD63P08962 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD63P08962 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD63P08962 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD63P08962 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD63P08962 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD63P08962 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD63P08962 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD63P08962 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD63P08962 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD63P08962 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD63P08962 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD63P08962 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms