Protein–RNA interactions for Protein: P08651

NFIC, Nuclear factor 1 C-type, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFICP08651 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NFICP08651 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NFICP08651 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NFICP08651 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NFICP08651 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NFICP08651 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
NFICP08651 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NFICP08651 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NFICP08651 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NFICP08651 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NFICP08651 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NFICP08651 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NFICP08651 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NFICP08651 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NFICP08651 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NFICP08651 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NFICP08651 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NFICP08651 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NFICP08651 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NFICP08651 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NFICP08651 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NFICP08651 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NFICP08651 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NFICP08651 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NFICP08651 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NFICP08651 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NFICP08651 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NFICP08651 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NFICP08651 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NFICP08651 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NFICP08651 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NFICP08651 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NFICP08651 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NFICP08651 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NFICP08651 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NFICP08651 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NFICP08651 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NFICP08651 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NFICP08651 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
NFICP08651 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NFICP08651 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NFICP08651 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NFICP08651 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NFICP08651 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NFICP08651 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NFICP08651 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NFICP08651 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NFICP08651 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NFICP08651 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NFICP08651 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NFICP08651 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NFICP08651 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NFICP08651 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NFICP08651 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NFICP08651 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NFICP08651 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NFICP08651 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NFICP08651 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NFICP08651 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NFICP08651 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NFICP08651 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NFICP08651 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NFICP08651 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NFICP08651 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NFICP08651 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NFICP08651 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NFICP08651 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NFICP08651 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NFICP08651 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NFICP08651 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NFICP08651 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NFICP08651 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NFICP08651 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NFICP08651 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NFICP08651 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NFICP08651 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NFICP08651 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NFICP08651 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NFICP08651 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NFICP08651 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NFICP08651 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NFICP08651 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NFICP08651 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NFICP08651 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NFICP08651 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NFICP08651 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NFICP08651 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NFICP08651 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NFICP08651 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NFICP08651 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NFICP08651 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NFICP08651 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NFICP08651 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NFICP08651 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NFICP08651 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NFICP08651 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NFICP08651 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NFICP08651 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NFICP08651 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NFICP08651 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 976.8 ms