Protein–RNA interactions for Protein: P08123

COL1A2, Collagen alpha-2(I) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL1A2P08123 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
COL1A2P08123 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
COL1A2P08123 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
COL1A2P08123 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
COL1A2P08123 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
COL1A2P08123 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
COL1A2P08123 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
COL1A2P08123 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
COL1A2P08123 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
COL1A2P08123 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
COL1A2P08123 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
COL1A2P08123 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
COL1A2P08123 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
COL1A2P08123 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
COL1A2P08123 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
COL1A2P08123 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
COL1A2P08123 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
COL1A2P08123 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
COL1A2P08123 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
COL1A2P08123 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
COL1A2P08123 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
COL1A2P08123 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
COL1A2P08123 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
COL1A2P08123 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
COL1A2P08123 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
COL1A2P08123 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
COL1A2P08123 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
COL1A2P08123 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
COL1A2P08123 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
COL1A2P08123 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
COL1A2P08123 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
COL1A2P08123 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
COL1A2P08123 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
COL1A2P08123 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
COL1A2P08123 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
COL1A2P08123 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
COL1A2P08123 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
COL1A2P08123 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
COL1A2P08123 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
COL1A2P08123 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
COL1A2P08123 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
COL1A2P08123 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
COL1A2P08123 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
COL1A2P08123 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
COL1A2P08123 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
COL1A2P08123 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
COL1A2P08123 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
COL1A2P08123 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
COL1A2P08123 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
COL1A2P08123 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
COL1A2P08123 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL1A2P08123 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL1A2P08123 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
COL1A2P08123 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL1A2P08123 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL1A2P08123 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL1A2P08123 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL1A2P08123 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL1A2P08123 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
COL1A2P08123 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
COL1A2P08123 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
COL1A2P08123 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
COL1A2P08123 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
COL1A2P08123 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
COL1A2P08123 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
COL1A2P08123 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
COL1A2P08123 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
COL1A2P08123 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
COL1A2P08123 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
COL1A2P08123 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
COL1A2P08123 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
COL1A2P08123 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
COL1A2P08123 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
COL1A2P08123 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
COL1A2P08123 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
COL1A2P08123 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
COL1A2P08123 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
COL1A2P08123 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
COL1A2P08123 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
COL1A2P08123 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COL1A2P08123 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
COL1A2P08123 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
COL1A2P08123 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COL1A2P08123 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COL1A2P08123 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COL1A2P08123 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COL1A2P08123 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
COL1A2P08123 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
COL1A2P08123 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
COL1A2P08123 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
COL1A2P08123 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
COL1A2P08123 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
COL1A2P08123 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
COL1A2P08123 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
COL1A2P08123 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
COL1A2P08123 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
COL1A2P08123 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
COL1A2P08123 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
COL1A2P08123 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
COL1A2P08123 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms