Protein–RNA interactions for Protein: P08047

SP1, Transcription factor Sp1, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP1P08047 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SP1P08047 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SP1P08047 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SP1P08047 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SP1P08047 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SP1P08047 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SP1P08047 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SP1P08047 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SP1P08047 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SP1P08047 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SP1P08047 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SP1P08047 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SP1P08047 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SP1P08047 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SP1P08047 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SP1P08047 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SP1P08047 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SP1P08047 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SP1P08047 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SP1P08047 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SP1P08047 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SP1P08047 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SP1P08047 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SP1P08047 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SP1P08047 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SP1P08047 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SP1P08047 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SP1P08047 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SP1P08047 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SP1P08047 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SP1P08047 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SP1P08047 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SP1P08047 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SP1P08047 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SP1P08047 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SP1P08047 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SP1P08047 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SP1P08047 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SP1P08047 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SP1P08047 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SP1P08047 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SP1P08047 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SP1P08047 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SP1P08047 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SP1P08047 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SP1P08047 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SP1P08047 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SP1P08047 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SP1P08047 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SP1P08047 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SP1P08047 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SP1P08047 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SP1P08047 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SP1P08047 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SP1P08047 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SP1P08047 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SP1P08047 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SP1P08047 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SP1P08047 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SP1P08047 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SP1P08047 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SP1P08047 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SP1P08047 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SP1P08047 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SP1P08047 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SP1P08047 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SP1P08047 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SP1P08047 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SP1P08047 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SP1P08047 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SP1P08047 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SP1P08047 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SP1P08047 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SP1P08047 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SP1P08047 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SP1P08047 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SP1P08047 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SP1P08047 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SP1P08047 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SP1P08047 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SP1P08047 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SP1P08047 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SP1P08047 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SP1P08047 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SP1P08047 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SP1P08047 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SP1P08047 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SP1P08047 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SP1P08047 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SP1P08047 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SP1P08047 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SP1P08047 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SP1P08047 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SP1P08047 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SP1P08047 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SP1P08047 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SP1P08047 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SP1P08047 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SP1P08047 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SP1P08047 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms