Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABARAPO95166 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABARAPO95166 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABARAPO95166 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABARAPO95166 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABARAPO95166 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABARAPO95166 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABARAPO95166 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABARAPO95166 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABARAPO95166 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABARAPO95166 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABARAPO95166 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABARAPO95166 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABARAPO95166 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABARAPO95166 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABARAPO95166 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABARAPO95166 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABARAPO95166 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABARAPO95166 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABARAPO95166 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABARAPO95166 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABARAPO95166 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABARAPO95166 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABARAPO95166 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABARAPO95166 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GABARAPO95166 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GABARAPO95166 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GABARAPO95166 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GABARAPO95166 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABARAPO95166 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABARAPO95166 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABARAPO95166 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABARAPO95166 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GABARAPO95166 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABARAPO95166 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABARAPO95166 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABARAPO95166 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABARAPO95166 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABARAPO95166 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABARAPO95166 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABARAPO95166 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABARAPO95166 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABARAPO95166 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABARAPO95166 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABARAPO95166 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABARAPO95166 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABARAPO95166 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABARAPO95166 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABARAPO95166 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABARAPO95166 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABARAPO95166 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABARAPO95166 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABARAPO95166 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABARAPO95166 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABARAPO95166 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABARAPO95166 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABARAPO95166 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABARAPO95166 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABARAPO95166 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABARAPO95166 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABARAPO95166 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABARAPO95166 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABARAPO95166 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABARAPO95166 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABARAPO95166 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABARAPO95166 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABARAPO95166 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABARAPO95166 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABARAPO95166 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABARAPO95166 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABARAPO95166 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABARAPO95166 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GABARAPO95166 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GABARAPO95166 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GABARAPO95166 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GABARAPO95166 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GABARAPO95166 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GABARAPO95166 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GABARAPO95166 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABARAPO95166 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABARAPO95166 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABARAPO95166 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABARAPO95166 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABARAPO95166 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABARAPO95166 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABARAPO95166 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABARAPO95166 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABARAPO95166 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABARAPO95166 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABARAPO95166 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABARAPO95166 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABARAPO95166 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABARAPO95166 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABARAPO95166 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABARAPO95166 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GABARAPO95166 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABARAPO95166 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABARAPO95166 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABARAPO95166 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABARAPO95166 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms