Protein–RNA interactions for Protein: O75177

SS18L1, Calcium-responsive transactivator, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18L1O75177 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SS18L1O75177 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SS18L1O75177 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SS18L1O75177 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SS18L1O75177 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SS18L1O75177 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SS18L1O75177 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SS18L1O75177 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SS18L1O75177 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SS18L1O75177 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SS18L1O75177 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SS18L1O75177 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SS18L1O75177 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SS18L1O75177 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SS18L1O75177 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SS18L1O75177 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SS18L1O75177 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SS18L1O75177 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SS18L1O75177 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SS18L1O75177 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SS18L1O75177 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SS18L1O75177 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SS18L1O75177 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SS18L1O75177 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SS18L1O75177 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SS18L1O75177 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SS18L1O75177 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SS18L1O75177 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SS18L1O75177 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SS18L1O75177 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SS18L1O75177 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SS18L1O75177 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SS18L1O75177 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SS18L1O75177 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SS18L1O75177 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SS18L1O75177 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SS18L1O75177 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SS18L1O75177 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SS18L1O75177 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SS18L1O75177 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SS18L1O75177 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SS18L1O75177 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SS18L1O75177 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SS18L1O75177 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SS18L1O75177 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SS18L1O75177 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SS18L1O75177 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SS18L1O75177 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SS18L1O75177 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SS18L1O75177 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SS18L1O75177 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SS18L1O75177 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SS18L1O75177 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SS18L1O75177 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SS18L1O75177 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SS18L1O75177 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SS18L1O75177 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SS18L1O75177 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SS18L1O75177 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SS18L1O75177 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SS18L1O75177 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SS18L1O75177 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SS18L1O75177 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SS18L1O75177 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SS18L1O75177 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SS18L1O75177 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SS18L1O75177 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SS18L1O75177 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SS18L1O75177 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SS18L1O75177 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SS18L1O75177 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SS18L1O75177 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SS18L1O75177 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SS18L1O75177 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SS18L1O75177 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SS18L1O75177 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SS18L1O75177 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SS18L1O75177 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SS18L1O75177 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SS18L1O75177 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SS18L1O75177 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SS18L1O75177 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SS18L1O75177 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SS18L1O75177 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SS18L1O75177 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SS18L1O75177 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SS18L1O75177 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SS18L1O75177 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SS18L1O75177 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SS18L1O75177 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SS18L1O75177 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SS18L1O75177 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SS18L1O75177 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SS18L1O75177 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SS18L1O75177 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SS18L1O75177 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SS18L1O75177 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SS18L1O75177 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SS18L1O75177 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SS18L1O75177 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms