Protein–RNA interactions for Protein: O75074

LRP3, Low-density lipoprotein receptor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP3O75074 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRP3O75074 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRP3O75074 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRP3O75074 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRP3O75074 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRP3O75074 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRP3O75074 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LRP3O75074 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRP3O75074 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRP3O75074 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRP3O75074 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRP3O75074 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRP3O75074 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
LRP3O75074 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
LRP3O75074 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRP3O75074 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRP3O75074 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRP3O75074 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRP3O75074 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRP3O75074 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRP3O75074 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LRP3O75074 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRP3O75074 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRP3O75074 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRP3O75074 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRP3O75074 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRP3O75074 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRP3O75074 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRP3O75074 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRP3O75074 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRP3O75074 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRP3O75074 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRP3O75074 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
LRP3O75074 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRP3O75074 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
LRP3O75074 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRP3O75074 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LRP3O75074 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRP3O75074 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRP3O75074 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRP3O75074 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRP3O75074 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRP3O75074 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
LRP3O75074 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRP3O75074 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRP3O75074 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRP3O75074 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRP3O75074 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRP3O75074 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRP3O75074 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRP3O75074 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRP3O75074 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRP3O75074 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRP3O75074 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRP3O75074 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRP3O75074 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRP3O75074 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRP3O75074 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRP3O75074 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRP3O75074 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LRP3O75074 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LRP3O75074 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LRP3O75074 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LRP3O75074 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRP3O75074 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRP3O75074 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRP3O75074 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRP3O75074 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRP3O75074 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRP3O75074 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRP3O75074 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRP3O75074 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRP3O75074 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LRP3O75074 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRP3O75074 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRP3O75074 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRP3O75074 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRP3O75074 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRP3O75074 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRP3O75074 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LRP3O75074 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
LRP3O75074 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRP3O75074 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRP3O75074 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
LRP3O75074 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRP3O75074 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRP3O75074 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRP3O75074 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LRP3O75074 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRP3O75074 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRP3O75074 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRP3O75074 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRP3O75074 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRP3O75074 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRP3O75074 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRP3O75074 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRP3O75074 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRP3O75074 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRP3O75074 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRP3O75074 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms