Protein–RNA interactions for Protein: O60811

PRAMEF2, PRAME family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF2O60811 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF2O60811 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF2O60811 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF2O60811 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF2O60811 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF2O60811 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF2O60811 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF2O60811 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF2O60811 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF2O60811 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF2O60811 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF2O60811 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF2O60811 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF2O60811 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRAMEF2O60811 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF2O60811 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF2O60811 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF2O60811 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF2O60811 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF2O60811 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF2O60811 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF2O60811 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF2O60811 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF2O60811 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF2O60811 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF2O60811 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF2O60811 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF2O60811 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF2O60811 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF2O60811 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF2O60811 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF2O60811 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF2O60811 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF2O60811 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF2O60811 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF2O60811 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF2O60811 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF2O60811 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF2O60811 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF2O60811 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF2O60811 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF2O60811 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF2O60811 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF2O60811 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF2O60811 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF2O60811 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF2O60811 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF2O60811 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF2O60811 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF2O60811 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF2O60811 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF2O60811 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF2O60811 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF2O60811 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF2O60811 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRAMEF2O60811 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF2O60811 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF2O60811 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF2O60811 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF2O60811 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF2O60811 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF2O60811 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF2O60811 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF2O60811 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF2O60811 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF2O60811 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF2O60811 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF2O60811 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF2O60811 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF2O60811 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF2O60811 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF2O60811 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF2O60811 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF2O60811 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF2O60811 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF2O60811 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF2O60811 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF2O60811 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF2O60811 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF2O60811 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF2O60811 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF2O60811 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF2O60811 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF2O60811 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF2O60811 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEF2O60811 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEF2O60811 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEF2O60811 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF2O60811 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF2O60811 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF2O60811 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF2O60811 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF2O60811 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF2O60811 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF2O60811 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF2O60811 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF2O60811 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF2O60811 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF2O60811 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF2O60811 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms