Protein–RNA interactions for Protein: O60361

NME2P1, Putative nucleoside diphosphate kinase, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME2P1O60361 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NME2P1O60361 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NME2P1O60361 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NME2P1O60361 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NME2P1O60361 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NME2P1O60361 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME2P1O60361 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME2P1O60361 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME2P1O60361 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME2P1O60361 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NME2P1O60361 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME2P1O60361 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME2P1O60361 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME2P1O60361 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME2P1O60361 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME2P1O60361 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME2P1O60361 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NME2P1O60361 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NME2P1O60361 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME2P1O60361 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME2P1O60361 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME2P1O60361 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME2P1O60361 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME2P1O60361 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME2P1O60361 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME2P1O60361 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME2P1O60361 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME2P1O60361 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME2P1O60361 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NME2P1O60361 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME2P1O60361 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME2P1O60361 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME2P1O60361 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME2P1O60361 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NME2P1O60361 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NME2P1O60361 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NME2P1O60361 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NME2P1O60361 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NME2P1O60361 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NME2P1O60361 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME2P1O60361 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NME2P1O60361 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME2P1O60361 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME2P1O60361 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME2P1O60361 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME2P1O60361 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME2P1O60361 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NME2P1O60361 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME2P1O60361 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME2P1O60361 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME2P1O60361 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NME2P1O60361 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NME2P1O60361 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NME2P1O60361 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NME2P1O60361 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NME2P1O60361 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NME2P1O60361 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NME2P1O60361 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NME2P1O60361 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NME2P1O60361 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NME2P1O60361 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NME2P1O60361 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NME2P1O60361 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NME2P1O60361 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME2P1O60361 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME2P1O60361 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME2P1O60361 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NME2P1O60361 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME2P1O60361 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME2P1O60361 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME2P1O60361 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME2P1O60361 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME2P1O60361 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME2P1O60361 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME2P1O60361 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NME2P1O60361 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NME2P1O60361 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NME2P1O60361 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NME2P1O60361 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME2P1O60361 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME2P1O60361 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME2P1O60361 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME2P1O60361 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME2P1O60361 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME2P1O60361 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME2P1O60361 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME2P1O60361 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NME2P1O60361 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NME2P1O60361 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NME2P1O60361 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NME2P1O60361 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NME2P1O60361 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NME2P1O60361 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NME2P1O60361 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NME2P1O60361 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NME2P1O60361 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NME2P1O60361 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NME2P1O60361 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NME2P1O60361 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NME2P1O60361 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms