Protein–RNA interactions for Protein: O43617

TRAPPC3, Trafficking protein particle complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3O43617 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAPPC3O43617 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAPPC3O43617 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAPPC3O43617 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAPPC3O43617 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAPPC3O43617 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAPPC3O43617 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAPPC3O43617 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAPPC3O43617 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAPPC3O43617 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAPPC3O43617 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAPPC3O43617 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAPPC3O43617 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAPPC3O43617 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAPPC3O43617 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAPPC3O43617 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAPPC3O43617 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAPPC3O43617 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAPPC3O43617 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAPPC3O43617 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAPPC3O43617 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAPPC3O43617 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAPPC3O43617 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAPPC3O43617 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAPPC3O43617 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAPPC3O43617 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAPPC3O43617 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAPPC3O43617 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAPPC3O43617 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAPPC3O43617 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAPPC3O43617 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAPPC3O43617 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAPPC3O43617 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAPPC3O43617 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAPPC3O43617 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAPPC3O43617 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAPPC3O43617 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAPPC3O43617 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAPPC3O43617 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAPPC3O43617 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAPPC3O43617 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAPPC3O43617 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAPPC3O43617 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAPPC3O43617 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAPPC3O43617 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAPPC3O43617 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAPPC3O43617 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAPPC3O43617 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAPPC3O43617 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAPPC3O43617 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAPPC3O43617 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAPPC3O43617 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAPPC3O43617 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRAPPC3O43617 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAPPC3O43617 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAPPC3O43617 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAPPC3O43617 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAPPC3O43617 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAPPC3O43617 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAPPC3O43617 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAPPC3O43617 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAPPC3O43617 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAPPC3O43617 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAPPC3O43617 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAPPC3O43617 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAPPC3O43617 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAPPC3O43617 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAPPC3O43617 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAPPC3O43617 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAPPC3O43617 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAPPC3O43617 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAPPC3O43617 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAPPC3O43617 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAPPC3O43617 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAPPC3O43617 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAPPC3O43617 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAPPC3O43617 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAPPC3O43617 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAPPC3O43617 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAPPC3O43617 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAPPC3O43617 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAPPC3O43617 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAPPC3O43617 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
TRAPPC3O43617 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAPPC3O43617 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAPPC3O43617 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAPPC3O43617 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAPPC3O43617 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAPPC3O43617 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAPPC3O43617 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAPPC3O43617 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAPPC3O43617 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAPPC3O43617 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAPPC3O43617 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAPPC3O43617 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAPPC3O43617 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAPPC3O43617 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAPPC3O43617 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAPPC3O43617 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAPPC3O43617 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms