Protein–RNA interactions for Protein: O43291

SPINT2, Kunitz-type protease inhibitor 2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINT2O43291 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPINT2O43291 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPINT2O43291 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPINT2O43291 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPINT2O43291 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPINT2O43291 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SPINT2O43291 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPINT2O43291 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPINT2O43291 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPINT2O43291 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPINT2O43291 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPINT2O43291 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPINT2O43291 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPINT2O43291 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPINT2O43291 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPINT2O43291 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPINT2O43291 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SPINT2O43291 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPINT2O43291 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPINT2O43291 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPINT2O43291 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPINT2O43291 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPINT2O43291 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPINT2O43291 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPINT2O43291 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPINT2O43291 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPINT2O43291 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPINT2O43291 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPINT2O43291 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPINT2O43291 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPINT2O43291 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPINT2O43291 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPINT2O43291 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SPINT2O43291 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPINT2O43291 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPINT2O43291 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPINT2O43291 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPINT2O43291 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPINT2O43291 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPINT2O43291 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SPINT2O43291 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SPINT2O43291 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SPINT2O43291 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPINT2O43291 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPINT2O43291 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPINT2O43291 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPINT2O43291 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SPINT2O43291 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SPINT2O43291 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SPINT2O43291 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SPINT2O43291 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SPINT2O43291 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPINT2O43291 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPINT2O43291 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPINT2O43291 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPINT2O43291 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPINT2O43291 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPINT2O43291 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPINT2O43291 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPINT2O43291 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPINT2O43291 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPINT2O43291 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPINT2O43291 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPINT2O43291 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SPINT2O43291 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPINT2O43291 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPINT2O43291 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPINT2O43291 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPINT2O43291 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPINT2O43291 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPINT2O43291 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPINT2O43291 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPINT2O43291 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPINT2O43291 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPINT2O43291 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPINT2O43291 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPINT2O43291 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPINT2O43291 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
SPINT2O43291 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPINT2O43291 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPINT2O43291 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPINT2O43291 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPINT2O43291 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPINT2O43291 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPINT2O43291 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPINT2O43291 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPINT2O43291 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPINT2O43291 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPINT2O43291 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPINT2O43291 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPINT2O43291 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPINT2O43291 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPINT2O43291 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPINT2O43291 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SPINT2O43291 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SPINT2O43291 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPINT2O43291 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPINT2O43291 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPINT2O43291 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPINT2O43291 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95 ms