Protein–RNA interactions for Protein: O43255

SIAH2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIAH2O43255 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIAH2O43255 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIAH2O43255 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIAH2O43255 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIAH2O43255 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIAH2O43255 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIAH2O43255 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIAH2O43255 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIAH2O43255 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIAH2O43255 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIAH2O43255 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIAH2O43255 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIAH2O43255 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIAH2O43255 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIAH2O43255 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SIAH2O43255 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SIAH2O43255 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SIAH2O43255 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SIAH2O43255 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SIAH2O43255 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIAH2O43255 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIAH2O43255 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SIAH2O43255 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
SIAH2O43255 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SIAH2O43255 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SIAH2O43255 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SIAH2O43255 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SIAH2O43255 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SIAH2O43255 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SIAH2O43255 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SIAH2O43255 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SIAH2O43255 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SIAH2O43255 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SIAH2O43255 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SIAH2O43255 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SIAH2O43255 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SIAH2O43255 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SIAH2O43255 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SIAH2O43255 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SIAH2O43255 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SIAH2O43255 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SIAH2O43255 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SIAH2O43255 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SIAH2O43255 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SIAH2O43255 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SIAH2O43255 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SIAH2O43255 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SIAH2O43255 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SIAH2O43255 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SIAH2O43255 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SIAH2O43255 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SIAH2O43255 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SIAH2O43255 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SIAH2O43255 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SIAH2O43255 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SIAH2O43255 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SIAH2O43255 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SIAH2O43255 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SIAH2O43255 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SIAH2O43255 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SIAH2O43255 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SIAH2O43255 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SIAH2O43255 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SIAH2O43255 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SIAH2O43255 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SIAH2O43255 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SIAH2O43255 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SIAH2O43255 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SIAH2O43255 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SIAH2O43255 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SIAH2O43255 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SIAH2O43255 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SIAH2O43255 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SIAH2O43255 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SIAH2O43255 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SIAH2O43255 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SIAH2O43255 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SIAH2O43255 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SIAH2O43255 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SIAH2O43255 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SIAH2O43255 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SIAH2O43255 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SIAH2O43255 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SIAH2O43255 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SIAH2O43255 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SIAH2O43255 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SIAH2O43255 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SIAH2O43255 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SIAH2O43255 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SIAH2O43255 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SIAH2O43255 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SIAH2O43255 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SIAH2O43255 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SIAH2O43255 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIAH2O43255 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIAH2O43255 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIAH2O43255 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SIAH2O43255 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIAH2O43255 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SIAH2O43255 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1022.6 ms