Protein–RNA interactions for Protein: O15344

MID1, E3 ubiquitin-protein ligase Midline-1, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID1O15344 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MID1O15344 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MID1O15344 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MID1O15344 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MID1O15344 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MID1O15344 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MID1O15344 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MID1O15344 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MID1O15344 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MID1O15344 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MID1O15344 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MID1O15344 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MID1O15344 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MID1O15344 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MID1O15344 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MID1O15344 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MID1O15344 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MID1O15344 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MID1O15344 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MID1O15344 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MID1O15344 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MID1O15344 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MID1O15344 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MID1O15344 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MID1O15344 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MID1O15344 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MID1O15344 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MID1O15344 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MID1O15344 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MID1O15344 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MID1O15344 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MID1O15344 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MID1O15344 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MID1O15344 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MID1O15344 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MID1O15344 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MID1O15344 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MID1O15344 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MID1O15344 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MID1O15344 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MID1O15344 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MID1O15344 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MID1O15344 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MID1O15344 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MID1O15344 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MID1O15344 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MID1O15344 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MID1O15344 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MID1O15344 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MID1O15344 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MID1O15344 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MID1O15344 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MID1O15344 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MID1O15344 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MID1O15344 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MID1O15344 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MID1O15344 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MID1O15344 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MID1O15344 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MID1O15344 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MID1O15344 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MID1O15344 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MID1O15344 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MID1O15344 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MID1O15344 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MID1O15344 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MID1O15344 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MID1O15344 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MID1O15344 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MID1O15344 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MID1O15344 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MID1O15344 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MID1O15344 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MID1O15344 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MID1O15344 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MID1O15344 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MID1O15344 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MID1O15344 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MID1O15344 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MID1O15344 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MID1O15344 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MID1O15344 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MID1O15344 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MID1O15344 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MID1O15344 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MID1O15344 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MID1O15344 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MID1O15344 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MID1O15344 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MID1O15344 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MID1O15344 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MID1O15344 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MID1O15344 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MID1O15344 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MID1O15344 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MID1O15344 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MID1O15344 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MID1O15344 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MID1O15344 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MID1O15344 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms