Protein–RNA interactions for Protein: O15335

CHAD, Chondroadherin, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHADO15335 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHADO15335 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHADO15335 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHADO15335 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHADO15335 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHADO15335 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHADO15335 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHADO15335 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHADO15335 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CHADO15335 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CHADO15335 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHADO15335 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHADO15335 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHADO15335 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHADO15335 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHADO15335 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHADO15335 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHADO15335 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHADO15335 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CHADO15335 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHADO15335 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHADO15335 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHADO15335 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHADO15335 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHADO15335 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHADO15335 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHADO15335 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHADO15335 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHADO15335 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHADO15335 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHADO15335 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CHADO15335 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHADO15335 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHADO15335 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHADO15335 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHADO15335 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHADO15335 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHADO15335 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHADO15335 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHADO15335 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CHADO15335 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHADO15335 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHADO15335 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHADO15335 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHADO15335 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHADO15335 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHADO15335 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHADO15335 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHADO15335 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHADO15335 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHADO15335 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHADO15335 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHADO15335 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHADO15335 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHADO15335 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHADO15335 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHADO15335 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHADO15335 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHADO15335 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHADO15335 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHADO15335 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHADO15335 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHADO15335 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHADO15335 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHADO15335 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHADO15335 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHADO15335 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHADO15335 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHADO15335 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHADO15335 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHADO15335 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHADO15335 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHADO15335 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHADO15335 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
CHADO15335 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHADO15335 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHADO15335 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHADO15335 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CHADO15335 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHADO15335 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHADO15335 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHADO15335 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHADO15335 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHADO15335 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHADO15335 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHADO15335 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHADO15335 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHADO15335 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHADO15335 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CHADO15335 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHADO15335 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHADO15335 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHADO15335 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHADO15335 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHADO15335 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CHADO15335 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHADO15335 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHADO15335 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CHADO15335 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHADO15335 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms