Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
SYNMO15061 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
SYNMO15061 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
SYNMO15061 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
SYNMO15061 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
SYNMO15061 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
SYNMO15061 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
SYNMO15061 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
SYNMO15061 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
SYNMO15061 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
SYNMO15061 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
SYNMO15061 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
SYNMO15061 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
SYNMO15061 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
SYNMO15061 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
SYNMO15061 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
SYNMO15061 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
SYNMO15061 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
SYNMO15061 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
SYNMO15061 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
SYNMO15061 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
SYNMO15061 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
SYNMO15061 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
SYNMO15061 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
SYNMO15061 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
SYNMO15061 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
SYNMO15061 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
SYNMO15061 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.27
SYNMO15061 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
SYNMO15061 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.27
SYNMO15061 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
SYNMO15061 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
SYNMO15061 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
SYNMO15061 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
SYNMO15061 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
SYNMO15061 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
SYNMO15061 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
SYNMO15061 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
SYNMO15061 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
SYNMO15061 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
SYNMO15061 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC35.48■■■■□ 3.27
SYNMO15061 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
SYNMO15061 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
SYNMO15061 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
SYNMO15061 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
SYNMO15061 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
SYNMO15061 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
SYNMO15061 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
SYNMO15061 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
SYNMO15061 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
SYNMO15061 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
SYNMO15061 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
SYNMO15061 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.45■■■■□ 3.27
SYNMO15061 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
SYNMO15061 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
SYNMO15061 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
SYNMO15061 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
SYNMO15061 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
SYNMO15061 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
SYNMO15061 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
SYNMO15061 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
SYNMO15061 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
SYNMO15061 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
SYNMO15061 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC35.42■■■■□ 3.26
SYNMO15061 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
SYNMO15061 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
SYNMO15061 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
SYNMO15061 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
SYNMO15061 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
SYNMO15061 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
SYNMO15061 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
SYNMO15061 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
SYNMO15061 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
SYNMO15061 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
SYNMO15061 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
SYNMO15061 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
SYNMO15061 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
SYNMO15061 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
SYNMO15061 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
SYNMO15061 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
SYNMO15061 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
SYNMO15061 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
SYNMO15061 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
SYNMO15061 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
SYNMO15061 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
SYNMO15061 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
SYNMO15061 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
SYNMO15061 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
SYNMO15061 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
SYNMO15061 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC35.35■■■■□ 3.25
SYNMO15061 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
SYNMO15061 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
SYNMO15061 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
SYNMO15061 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
SYNMO15061 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
SYNMO15061 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
SYNMO15061 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
SYNMO15061 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
SYNMO15061 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
SYNMO15061 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms