Protein–RNA interactions for Protein: O14745

SLC9A3R1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3R1O14745 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC9A3R1O14745 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC9A3R1O14745 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC9A3R1O14745 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC9A3R1O14745 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC9A3R1O14745 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC9A3R1O14745 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC9A3R1O14745 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC9A3R1O14745 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC9A3R1O14745 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC9A3R1O14745 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC9A3R1O14745 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC9A3R1O14745 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC9A3R1O14745 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC9A3R1O14745 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC9A3R1O14745 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC9A3R1O14745 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC9A3R1O14745 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC9A3R1O14745 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC9A3R1O14745 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC9A3R1O14745 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC9A3R1O14745 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC9A3R1O14745 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC9A3R1O14745 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC9A3R1O14745 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC9A3R1O14745 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC9A3R1O14745 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC9A3R1O14745 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC9A3R1O14745 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC9A3R1O14745 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC9A3R1O14745 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC9A3R1O14745 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC9A3R1O14745 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC9A3R1O14745 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC9A3R1O14745 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC9A3R1O14745 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC9A3R1O14745 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC9A3R1O14745 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC9A3R1O14745 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC9A3R1O14745 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC9A3R1O14745 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC9A3R1O14745 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC9A3R1O14745 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC9A3R1O14745 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC9A3R1O14745 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC9A3R1O14745 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC9A3R1O14745 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC9A3R1O14745 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC9A3R1O14745 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC9A3R1O14745 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC9A3R1O14745 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC9A3R1O14745 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC9A3R1O14745 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC9A3R1O14745 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC9A3R1O14745 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC9A3R1O14745 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC9A3R1O14745 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC9A3R1O14745 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC9A3R1O14745 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC9A3R1O14745 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC9A3R1O14745 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC9A3R1O14745 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC9A3R1O14745 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC9A3R1O14745 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC9A3R1O14745 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC9A3R1O14745 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC9A3R1O14745 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC9A3R1O14745 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC9A3R1O14745 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC9A3R1O14745 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC9A3R1O14745 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC9A3R1O14745 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC9A3R1O14745 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC9A3R1O14745 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC9A3R1O14745 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC9A3R1O14745 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC9A3R1O14745 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC9A3R1O14745 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC9A3R1O14745 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC9A3R1O14745 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC9A3R1O14745 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC9A3R1O14745 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC9A3R1O14745 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC9A3R1O14745 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC9A3R1O14745 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC9A3R1O14745 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC9A3R1O14745 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC9A3R1O14745 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC9A3R1O14745 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC9A3R1O14745 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC9A3R1O14745 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC9A3R1O14745 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC9A3R1O14745 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC9A3R1O14745 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC9A3R1O14745 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC9A3R1O14745 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC9A3R1O14745 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC9A3R1O14745 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC9A3R1O14745 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC9A3R1O14745 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms