Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
PTPRTO14522 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
PTPRTO14522 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
PTPRTO14522 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
PTPRTO14522 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
PTPRTO14522 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
PTPRTO14522 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.96■■■■□ 3.35
PTPRTO14522 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC35.96■■■■□ 3.35
PTPRTO14522 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
PTPRTO14522 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
PTPRTO14522 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
PTPRTO14522 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
PTPRTO14522 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
PTPRTO14522 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
PTPRTO14522 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
PTPRTO14522 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
PTPRTO14522 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
PTPRTO14522 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
PTPRTO14522 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
PTPRTO14522 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
PTPRTO14522 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
PTPRTO14522 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
PTPRTO14522 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
PTPRTO14522 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
PTPRTO14522 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
PTPRTO14522 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
PTPRTO14522 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
PTPRTO14522 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC35.92■■■■□ 3.34
PTPRTO14522 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
PTPRTO14522 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
PTPRTO14522 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
PTPRTO14522 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
PTPRTO14522 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
PTPRTO14522 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
PTPRTO14522 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC35.91■■■■□ 3.34
PTPRTO14522 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
PTPRTO14522 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
PTPRTO14522 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
PTPRTO14522 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
PTPRTO14522 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
PTPRTO14522 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
PTPRTO14522 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
PTPRTO14522 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
PTPRTO14522 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
PTPRTO14522 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
PTPRTO14522 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
PTPRTO14522 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
PTPRTO14522 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
PTPRTO14522 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
PTPRTO14522 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
PTPRTO14522 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC35.86■■■■□ 3.33
PTPRTO14522 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
PTPRTO14522 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
PTPRTO14522 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC35.85■■■■□ 3.33
PTPRTO14522 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
PTPRTO14522 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
PTPRTO14522 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
PTPRTO14522 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
PTPRTO14522 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
PTPRTO14522 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
PTPRTO14522 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
PTPRTO14522 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
PTPRTO14522 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
PTPRTO14522 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
PTPRTO14522 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
PTPRTO14522 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC35.82■■■■□ 3.33
PTPRTO14522 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
PTPRTO14522 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
PTPRTO14522 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
PTPRTO14522 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
PTPRTO14522 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
PTPRTO14522 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
PTPRTO14522 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
PTPRTO14522 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
PTPRTO14522 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
PTPRTO14522 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
PTPRTO14522 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
PTPRTO14522 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.8■■■■□ 3.32
PTPRTO14522 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
PTPRTO14522 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
PTPRTO14522 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
PTPRTO14522 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
PTPRTO14522 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
PTPRTO14522 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
PTPRTO14522 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
PTPRTO14522 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
PTPRTO14522 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
PTPRTO14522 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
PTPRTO14522 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
PTPRTO14522 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
PTPRTO14522 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
PTPRTO14522 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
PTPRTO14522 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
PTPRTO14522 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
PTPRTO14522 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
PTPRTO14522 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
PTPRTO14522 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
PTPRTO14522 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
PTPRTO14522 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
PTPRTO14522 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
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