Protein–RNA interactions for Protein: J3KT08

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KT08 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3KT08 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3KT08 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3KT08 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3KT08 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3KT08 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3KT08 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3KT08 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3KT08 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3KT08 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3KT08 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3KT08 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
J3KT08 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
J3KT08 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
J3KT08 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
J3KT08 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
J3KT08 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
J3KT08 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
J3KT08 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
J3KT08 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
J3KT08 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
J3KT08 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
J3KT08 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
J3KT08 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
J3KT08 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
J3KT08 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
J3KT08 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
J3KT08 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
J3KT08 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
J3KT08 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
J3KT08 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
J3KT08 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
J3KT08 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
J3KT08 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
J3KT08 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
J3KT08 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
J3KT08 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
J3KT08 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
J3KT08 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
J3KT08 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
J3KT08 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
J3KT08 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
J3KT08 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
J3KT08 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
J3KT08 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
J3KT08 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
J3KT08 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
J3KT08 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
J3KT08 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
J3KT08 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
J3KT08 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
J3KT08 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
J3KT08 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
J3KT08 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
J3KT08 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
J3KT08 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
J3KT08 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
J3KT08 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
J3KT08 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
J3KT08 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
J3KT08 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
J3KT08 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
J3KT08 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
J3KT08 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
J3KT08 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
J3KT08 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
J3KT08 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
J3KT08 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
J3KT08 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
J3KT08 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
J3KT08 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
J3KT08 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
J3KT08 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
J3KT08 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
J3KT08 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
J3KT08 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
J3KT08 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
J3KT08 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
J3KT08 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
J3KT08 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
J3KT08 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
J3KT08 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
J3KT08 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
J3KT08 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
J3KT08 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
J3KT08 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
J3KT08 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
J3KT08 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
J3KT08 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
J3KT08 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
J3KT08 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
J3KT08 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
J3KT08 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
J3KT08 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
J3KT08 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
J3KT08 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
J3KT08 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
J3KT08 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
J3KT08 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
J3KT08 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms