Protein–RNA interactions for Protein: H7C417

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C417 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H7C417 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H7C417 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H7C417 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H7C417 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H7C417 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H7C417 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H7C417 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H7C417 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H7C417 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H7C417 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H7C417 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H7C417 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H7C417 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H7C417 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H7C417 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H7C417 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H7C417 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H7C417 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H7C417 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H7C417 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H7C417 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H7C417 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
H7C417 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
H7C417 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H7C417 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H7C417 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H7C417 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H7C417 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H7C417 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
H7C417 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
H7C417 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.32■■□□□ 1
H7C417 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H7C417 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H7C417 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H7C417 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.32■■□□□ 1
H7C417 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H7C417 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
H7C417 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.31■■□□□ 1
H7C417 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.31■■□□□ 1
H7C417 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H7C417 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H7C417 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H7C417 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
H7C417 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H7C417 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
H7C417 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H7C417 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H7C417 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
H7C417 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H7C417 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H7C417 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
H7C417 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
H7C417 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H7C417 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
H7C417 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
H7C417 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H7C417 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
H7C417 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H7C417 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H7C417 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
H7C417 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H7C417 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H7C417 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
H7C417 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H7C417 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
H7C417 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H7C417 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
H7C417 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
H7C417 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
H7C417 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
H7C417 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
H7C417 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H7C417 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
H7C417 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
H7C417 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
H7C417 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H7C417 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
H7C417 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H7C417 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H7C417 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H7C417 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
H7C417 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H7C417 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H7C417 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H7C417 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H7C417 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
H7C417 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
H7C417 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H7C417 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H7C417 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
H7C417 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
H7C417 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H7C417 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H7C417 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
H7C417 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
H7C417 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
H7C417 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
H7C417 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
H7C417 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 453.8 ms