Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.6 ms