Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

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Length 477 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ERVV-1B6SEH8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
ERVV-1B6SEH8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ERVV-1B6SEH8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
ERVV-1B6SEH8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ERVV-1B6SEH8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
ERVV-1B6SEH8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
ERVV-1B6SEH8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
ERVV-1B6SEH8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
ERVV-1B6SEH8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
ERVV-1B6SEH8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
ERVV-1B6SEH8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
ERVV-1B6SEH8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
ERVV-1B6SEH8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
ERVV-1B6SEH8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
ERVV-1B6SEH8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
ERVV-1B6SEH8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
ERVV-1B6SEH8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
ERVV-1B6SEH8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
ERVV-1B6SEH8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
ERVV-1B6SEH8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
ERVV-1B6SEH8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
ERVV-1B6SEH8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ERVV-1B6SEH8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ERVV-1B6SEH8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ERVV-1B6SEH8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
ERVV-1B6SEH8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
ERVV-1B6SEH8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ERVV-1B6SEH8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
ERVV-1B6SEH8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC30.72■■■□□ 2.51
ERVV-1B6SEH8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
ERVV-1B6SEH8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
ERVV-1B6SEH8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
ERVV-1B6SEH8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
ERVV-1B6SEH8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
ERVV-1B6SEH8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
ERVV-1B6SEH8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
ERVV-1B6SEH8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
ERVV-1B6SEH8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
ERVV-1B6SEH8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
ERVV-1B6SEH8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
ERVV-1B6SEH8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
ERVV-1B6SEH8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
ERVV-1B6SEH8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
ERVV-1B6SEH8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
ERVV-1B6SEH8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
ERVV-1B6SEH8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
ERVV-1B6SEH8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
ERVV-1B6SEH8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
ERVV-1B6SEH8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
ERVV-1B6SEH8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
ERVV-1B6SEH8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
ERVV-1B6SEH8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
ERVV-1B6SEH8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
ERVV-1B6SEH8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
ERVV-1B6SEH8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
ERVV-1B6SEH8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
ERVV-1B6SEH8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
ERVV-1B6SEH8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
ERVV-1B6SEH8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
ERVV-1B6SEH8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
ERVV-1B6SEH8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
ERVV-1B6SEH8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
ERVV-1B6SEH8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
ERVV-1B6SEH8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
ERVV-1B6SEH8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
ERVV-1B6SEH8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
ERVV-1B6SEH8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
ERVV-1B6SEH8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
ERVV-1B6SEH8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
ERVV-1B6SEH8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
ERVV-1B6SEH8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
ERVV-1B6SEH8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
ERVV-1B6SEH8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ERVV-1B6SEH8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ERVV-1B6SEH8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
ERVV-1B6SEH8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
ERVV-1B6SEH8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
ERVV-1B6SEH8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ERVV-1B6SEH8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
ERVV-1B6SEH8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC30.6■■■□□ 2.49
ERVV-1B6SEH8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
ERVV-1B6SEH8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ERVV-1B6SEH8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ERVV-1B6SEH8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
ERVV-1B6SEH8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ERVV-1B6SEH8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
ERVV-1B6SEH8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
ERVV-1B6SEH8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
ERVV-1B6SEH8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
ERVV-1B6SEH8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
ERVV-1B6SEH8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ERVV-1B6SEH8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ERVV-1B6SEH8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ERVV-1B6SEH8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ERVV-1B6SEH8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ERVV-1B6SEH8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ERVV-1B6SEH8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ERVV-1B6SEH8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ERVV-1B6SEH8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
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