Protein–RNA interactions for Protein: B4DS77

SHISA9, Protein shisa-9, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA9B4DS77 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SHISA9B4DS77 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SHISA9B4DS77 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SHISA9B4DS77 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SHISA9B4DS77 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SHISA9B4DS77 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SHISA9B4DS77 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SHISA9B4DS77 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SHISA9B4DS77 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SHISA9B4DS77 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SHISA9B4DS77 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SHISA9B4DS77 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SHISA9B4DS77 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SHISA9B4DS77 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SHISA9B4DS77 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SHISA9B4DS77 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SHISA9B4DS77 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SHISA9B4DS77 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SHISA9B4DS77 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SHISA9B4DS77 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SHISA9B4DS77 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SHISA9B4DS77 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SHISA9B4DS77 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SHISA9B4DS77 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SHISA9B4DS77 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SHISA9B4DS77 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SHISA9B4DS77 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SHISA9B4DS77 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SHISA9B4DS77 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SHISA9B4DS77 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SHISA9B4DS77 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SHISA9B4DS77 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SHISA9B4DS77 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SHISA9B4DS77 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SHISA9B4DS77 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SHISA9B4DS77 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SHISA9B4DS77 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SHISA9B4DS77 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SHISA9B4DS77 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SHISA9B4DS77 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SHISA9B4DS77 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SHISA9B4DS77 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SHISA9B4DS77 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SHISA9B4DS77 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SHISA9B4DS77 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SHISA9B4DS77 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SHISA9B4DS77 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SHISA9B4DS77 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SHISA9B4DS77 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SHISA9B4DS77 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SHISA9B4DS77 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SHISA9B4DS77 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SHISA9B4DS77 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SHISA9B4DS77 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SHISA9B4DS77 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SHISA9B4DS77 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SHISA9B4DS77 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SHISA9B4DS77 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SHISA9B4DS77 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SHISA9B4DS77 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SHISA9B4DS77 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SHISA9B4DS77 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SHISA9B4DS77 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SHISA9B4DS77 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SHISA9B4DS77 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SHISA9B4DS77 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SHISA9B4DS77 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SHISA9B4DS77 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SHISA9B4DS77 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SHISA9B4DS77 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SHISA9B4DS77 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SHISA9B4DS77 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SHISA9B4DS77 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SHISA9B4DS77 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SHISA9B4DS77 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SHISA9B4DS77 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SHISA9B4DS77 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SHISA9B4DS77 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SHISA9B4DS77 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SHISA9B4DS77 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SHISA9B4DS77 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SHISA9B4DS77 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SHISA9B4DS77 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SHISA9B4DS77 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SHISA9B4DS77 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SHISA9B4DS77 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SHISA9B4DS77 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SHISA9B4DS77 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SHISA9B4DS77 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SHISA9B4DS77 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SHISA9B4DS77 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SHISA9B4DS77 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SHISA9B4DS77 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SHISA9B4DS77 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SHISA9B4DS77 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SHISA9B4DS77 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SHISA9B4DS77 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SHISA9B4DS77 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SHISA9B4DS77 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SHISA9B4DS77 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms