Protein–RNA interactions for Protein: A6NFQ2

TCAF2, TRPM8 channel-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCAF2A6NFQ2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCAF2A6NFQ2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCAF2A6NFQ2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCAF2A6NFQ2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TCAF2A6NFQ2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCAF2A6NFQ2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCAF2A6NFQ2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TCAF2A6NFQ2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCAF2A6NFQ2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCAF2A6NFQ2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCAF2A6NFQ2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TCAF2A6NFQ2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TCAF2A6NFQ2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCAF2A6NFQ2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCAF2A6NFQ2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCAF2A6NFQ2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCAF2A6NFQ2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCAF2A6NFQ2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCAF2A6NFQ2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TCAF2A6NFQ2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCAF2A6NFQ2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TCAF2A6NFQ2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCAF2A6NFQ2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCAF2A6NFQ2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCAF2A6NFQ2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCAF2A6NFQ2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TCAF2A6NFQ2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCAF2A6NFQ2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCAF2A6NFQ2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCAF2A6NFQ2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TCAF2A6NFQ2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TCAF2A6NFQ2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TCAF2A6NFQ2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TCAF2A6NFQ2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCAF2A6NFQ2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCAF2A6NFQ2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCAF2A6NFQ2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCAF2A6NFQ2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCAF2A6NFQ2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCAF2A6NFQ2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCAF2A6NFQ2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TCAF2A6NFQ2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TCAF2A6NFQ2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TCAF2A6NFQ2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TCAF2A6NFQ2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TCAF2A6NFQ2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TCAF2A6NFQ2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TCAF2A6NFQ2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TCAF2A6NFQ2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TCAF2A6NFQ2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TCAF2A6NFQ2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TCAF2A6NFQ2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TCAF2A6NFQ2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TCAF2A6NFQ2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TCAF2A6NFQ2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TCAF2A6NFQ2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TCAF2A6NFQ2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCAF2A6NFQ2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCAF2A6NFQ2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCAF2A6NFQ2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCAF2A6NFQ2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCAF2A6NFQ2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCAF2A6NFQ2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCAF2A6NFQ2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCAF2A6NFQ2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCAF2A6NFQ2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TCAF2A6NFQ2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCAF2A6NFQ2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCAF2A6NFQ2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCAF2A6NFQ2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TCAF2A6NFQ2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TCAF2A6NFQ2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TCAF2A6NFQ2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TCAF2A6NFQ2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCAF2A6NFQ2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCAF2A6NFQ2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCAF2A6NFQ2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCAF2A6NFQ2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCAF2A6NFQ2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCAF2A6NFQ2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCAF2A6NFQ2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TCAF2A6NFQ2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TCAF2A6NFQ2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TCAF2A6NFQ2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TCAF2A6NFQ2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TCAF2A6NFQ2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCAF2A6NFQ2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCAF2A6NFQ2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCAF2A6NFQ2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCAF2A6NFQ2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCAF2A6NFQ2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCAF2A6NFQ2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCAF2A6NFQ2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCAF2A6NFQ2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCAF2A6NFQ2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCAF2A6NFQ2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCAF2A6NFQ2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCAF2A6NFQ2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCAF2A6NFQ2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCAF2A6NFQ2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.4 ms