Protein–RNA interactions for Protein: A2RUB6

CCDC66, Coiled-coil domain-containing protein 66, humanhuman

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC66A2RUB6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC66A2RUB6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC66A2RUB6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC66A2RUB6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC66A2RUB6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC66A2RUB6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC66A2RUB6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC66A2RUB6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC66A2RUB6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC66A2RUB6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC66A2RUB6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC66A2RUB6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC66A2RUB6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC66A2RUB6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCDC66A2RUB6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCDC66A2RUB6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC66A2RUB6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC66A2RUB6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC66A2RUB6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC66A2RUB6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC66A2RUB6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC66A2RUB6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC66A2RUB6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC66A2RUB6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC66A2RUB6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC66A2RUB6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC66A2RUB6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC66A2RUB6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC66A2RUB6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC66A2RUB6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC66A2RUB6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC66A2RUB6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC66A2RUB6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC66A2RUB6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC66A2RUB6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC66A2RUB6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC66A2RUB6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC66A2RUB6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC66A2RUB6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC66A2RUB6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC66A2RUB6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC66A2RUB6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC66A2RUB6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC66A2RUB6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC66A2RUB6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC66A2RUB6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC66A2RUB6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC66A2RUB6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC66A2RUB6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC66A2RUB6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC66A2RUB6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC66A2RUB6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC66A2RUB6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC66A2RUB6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC66A2RUB6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC66A2RUB6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC66A2RUB6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC66A2RUB6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC66A2RUB6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC66A2RUB6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC66A2RUB6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC66A2RUB6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC66A2RUB6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC66A2RUB6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC66A2RUB6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC66A2RUB6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC66A2RUB6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC66A2RUB6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC66A2RUB6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC66A2RUB6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC66A2RUB6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC66A2RUB6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC66A2RUB6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC66A2RUB6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC66A2RUB6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC66A2RUB6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC66A2RUB6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC66A2RUB6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC66A2RUB6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC66A2RUB6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC66A2RUB6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC66A2RUB6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC66A2RUB6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC66A2RUB6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC66A2RUB6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC66A2RUB6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC66A2RUB6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC66A2RUB6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC66A2RUB6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC66A2RUB6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC66A2RUB6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC66A2RUB6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC66A2RUB6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC66A2RUB6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC66A2RUB6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC66A2RUB6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC66A2RUB6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC66A2RUB6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC66A2RUB6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC66A2RUB6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms