Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PIPSLA2A3N6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PIPSLA2A3N6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIPSLA2A3N6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIPSLA2A3N6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIPSLA2A3N6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIPSLA2A3N6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIPSLA2A3N6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PIPSLA2A3N6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIPSLA2A3N6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIPSLA2A3N6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PIPSLA2A3N6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIPSLA2A3N6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIPSLA2A3N6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIPSLA2A3N6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIPSLA2A3N6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIPSLA2A3N6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIPSLA2A3N6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PIPSLA2A3N6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PIPSLA2A3N6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PIPSLA2A3N6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PIPSLA2A3N6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PIPSLA2A3N6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIPSLA2A3N6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIPSLA2A3N6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIPSLA2A3N6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIPSLA2A3N6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PIPSLA2A3N6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIPSLA2A3N6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIPSLA2A3N6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIPSLA2A3N6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIPSLA2A3N6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIPSLA2A3N6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PIPSLA2A3N6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PIPSLA2A3N6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIPSLA2A3N6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIPSLA2A3N6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIPSLA2A3N6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PIPSLA2A3N6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PIPSLA2A3N6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PIPSLA2A3N6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PIPSLA2A3N6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PIPSLA2A3N6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PIPSLA2A3N6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PIPSLA2A3N6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PIPSLA2A3N6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PIPSLA2A3N6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PIPSLA2A3N6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PIPSLA2A3N6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PIPSLA2A3N6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PIPSLA2A3N6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PIPSLA2A3N6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PIPSLA2A3N6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PIPSLA2A3N6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PIPSLA2A3N6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PIPSLA2A3N6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIPSLA2A3N6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIPSLA2A3N6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIPSLA2A3N6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIPSLA2A3N6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIPSLA2A3N6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIPSLA2A3N6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIPSLA2A3N6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PIPSLA2A3N6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PIPSLA2A3N6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PIPSLA2A3N6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PIPSLA2A3N6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PIPSLA2A3N6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIPSLA2A3N6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIPSLA2A3N6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIPSLA2A3N6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIPSLA2A3N6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIPSLA2A3N6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIPSLA2A3N6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIPSLA2A3N6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIPSLA2A3N6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIPSLA2A3N6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIPSLA2A3N6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIPSLA2A3N6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIPSLA2A3N6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIPSLA2A3N6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIPSLA2A3N6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIPSLA2A3N6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIPSLA2A3N6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIPSLA2A3N6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIPSLA2A3N6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIPSLA2A3N6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PIPSLA2A3N6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIPSLA2A3N6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIPSLA2A3N6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIPSLA2A3N6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIPSLA2A3N6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIPSLA2A3N6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIPSLA2A3N6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PIPSLA2A3N6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIPSLA2A3N6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIPSLA2A3N6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PIPSLA2A3N6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PIPSLA2A3N6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIPSLA2A3N6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms