Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GVM2

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1B0GVM2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
A0A1B0GVM2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
A0A1B0GVM2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
A0A1B0GVM2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
A0A1B0GVM2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
A0A1B0GVM2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
A0A1B0GVM2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
A0A1B0GVM2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
A0A1B0GVM2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
A0A1B0GVM2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
A0A1B0GVM2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
A0A1B0GVM2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
A0A1B0GVM2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
A0A1B0GVM2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
A0A1B0GVM2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
A0A1B0GVM2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
A0A1B0GVM2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
A0A1B0GVM2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
A0A1B0GVM2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
A0A1B0GVM2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
A0A1B0GVM2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
A0A1B0GVM2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
A0A1B0GVM2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
A0A1B0GVM2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
A0A1B0GVM2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
A0A1B0GVM2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
A0A1B0GVM2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
A0A1B0GVM2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
A0A1B0GVM2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
A0A1B0GVM2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
A0A1B0GVM2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
A0A1B0GVM2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
A0A1B0GVM2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
A0A1B0GVM2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
A0A1B0GVM2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
A0A1B0GVM2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
A0A1B0GVM2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
A0A1B0GVM2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
A0A1B0GVM2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
A0A1B0GVM2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
A0A1B0GVM2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
A0A1B0GVM2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
A0A1B0GVM2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
A0A1B0GVM2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
A0A1B0GVM2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A1B0GVM2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A1B0GVM2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A1B0GVM2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A1B0GVM2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A1B0GVM2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A1B0GVM2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A1B0GVM2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A1B0GVM2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A1B0GVM2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A1B0GVM2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
A0A1B0GVM2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
A0A1B0GVM2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
A0A1B0GVM2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
A0A1B0GVM2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
A0A1B0GVM2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
A0A1B0GVM2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
A0A1B0GVM2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
A0A1B0GVM2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
A0A1B0GVM2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
A0A1B0GVM2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
A0A1B0GVM2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
A0A1B0GVM2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
A0A1B0GVM2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
A0A1B0GVM2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
A0A1B0GVM2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
A0A1B0GVM2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
A0A1B0GVM2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
A0A1B0GVM2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
A0A1B0GVM2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
A0A1B0GVM2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
A0A1B0GVM2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
A0A1B0GVM2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
A0A1B0GVM2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
A0A1B0GVM2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
A0A1B0GVM2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
A0A1B0GVM2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
A0A1B0GVM2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
A0A1B0GVM2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
A0A1B0GVM2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
A0A1B0GVM2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
A0A1B0GVM2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
A0A1B0GVM2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A1B0GVM2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A1B0GVM2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A1B0GVM2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A1B0GVM2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A1B0GVM2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A1B0GVM2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A1B0GVM2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A1B0GVM2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A1B0GVM2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A1B0GVM2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A1B0GVM2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A1B0GVM2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A1B0GVM2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms