Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GUH1

Aminomethyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1B0GUH1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A1B0GUH1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A1B0GUH1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A1B0GUH1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A1B0GUH1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A1B0GUH1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A1B0GUH1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A1B0GUH1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A1B0GUH1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A1B0GUH1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A1B0GUH1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A1B0GUH1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A1B0GUH1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A1B0GUH1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A1B0GUH1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A1B0GUH1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A1B0GUH1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A1B0GUH1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A1B0GUH1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A1B0GUH1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A1B0GUH1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A1B0GUH1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A1B0GUH1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A1B0GUH1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A1B0GUH1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A1B0GUH1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A1B0GUH1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A1B0GUH1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A1B0GUH1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A1B0GUH1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A1B0GUH1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A1B0GUH1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A1B0GUH1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A1B0GUH1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A1B0GUH1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A1B0GUH1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A1B0GUH1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A1B0GUH1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A1B0GUH1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A1B0GUH1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A1B0GUH1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A1B0GUH1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A1B0GUH1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A1B0GUH1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A1B0GUH1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
A0A1B0GUH1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
A0A1B0GUH1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A1B0GUH1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A1B0GUH1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A1B0GUH1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A1B0GUH1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A1B0GUH1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A1B0GUH1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A1B0GUH1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A1B0GUH1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A1B0GUH1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A1B0GUH1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A1B0GUH1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A1B0GUH1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
A0A1B0GUH1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A1B0GUH1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
A0A1B0GUH1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A1B0GUH1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A1B0GUH1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A1B0GUH1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A1B0GUH1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A1B0GUH1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A1B0GUH1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A1B0GUH1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A1B0GUH1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A1B0GUH1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A1B0GUH1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A1B0GUH1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A1B0GUH1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A1B0GUH1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A1B0GUH1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A1B0GUH1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A1B0GUH1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A1B0GUH1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A1B0GUH1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A1B0GUH1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A1B0GUH1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A1B0GUH1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A1B0GUH1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A1B0GUH1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A1B0GUH1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A1B0GUH1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A1B0GUH1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A1B0GUH1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A1B0GUH1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A1B0GUH1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A1B0GUH1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A1B0GUH1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A1B0GUH1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A1B0GUH1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A1B0GUH1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A1B0GUH1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A1B0GUH1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A1B0GUH1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A1B0GUH1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms