Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms