Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms