Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 AL662884.1-201ENST00000559458 662 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.83e-8■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.675e-29■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 RPS6-201ENST00000315377 863 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.015e-29■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 RPS6-204ENST00000380394 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.755e-29■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.633e-9■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.651e-9■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.851e-9■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 CHTF8-201ENST00000306585 2561 ntBASIC12.47□□□□□ -0.411e-9■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.242e-8■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 MAGOH-204ENST00000495868 695 ntTSL 1 (best)12.22□□□□□ -0.452e-8■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 MAGOH-201ENST00000371466 500 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.732e-8■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 SLC39A4-208ENST00000531789 361 ntTSL 315.64■□□□□ 0.096e-18■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 MTCH2-202ENST00000525649 599 ntTSL 24.89□□□□□ -1.638e-35■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 SVIP-205ENST00000533774 829 ntTSL 315.34■□□□□ 0.052e-6■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 SVIP-201ENST00000354193 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.412e-6■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 SVIP-204ENST00000530199 549 ntTSL 28.77□□□□□ -1.012e-6■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 SVIP-202ENST00000525670 581 ntTSL 26.01□□□□□ -1.452e-6■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.922e-42■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 FADS1-211ENST00000536991 2701 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.782e-42■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 RPL23-205ENST00000470646 333 ntTSL 315.46■□□□□ 0.071e-85■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 RPL23-202ENST00000378096 392 ntTSL 314.45□□□□□ -0.11e-85■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 PHF5A-202ENST00000459687 504 ntTSL 36.54□□□□□ -1.363e-6■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.039e-7■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 POLD1-212ENST00000600859 3474 ntTSL 215.2■□□□□ 0.029e-7■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.019e-7■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.049e-7■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 POLD1-201ENST00000440232 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.079e-7■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 GNAI2-206ENST00000446079 2086 ntTSL 1 (best)16.9■□□□□ 0.32e-7■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.12e-7■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 RPS27A-204ENST00000449323 422 ntTSL 35.65□□□□□ -1.54e-44■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 RPS27A-208ENST00000478196 580 ntTSL 24.65□□□□□ -1.674e-44■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 PSMA6-204ENST00000553809 879 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.131e-14■■□□□ 14.3
PABPC4Q13310 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.641e-6■■□□□ 14.3
PABPC4Q13310 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.461e-6■■□□□ 14.3
PABPC4Q13310 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.421e-6■■□□□ 14.3
PABPC4Q13310 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.261e-6■■□□□ 14.3
PABPC4Q13310 SH3GLB2-206ENST00000417224 1468 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.011e-6■■□□□ 14.3
PABPC4Q13310 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.477e-8■■□□□ 14.3
PABPC4Q13310 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.17e-8■■□□□ 14.3
PABPC4Q13310 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.17e-8■■□□□ 14.3
PABPC4Q13310 ABT1-201ENST00000274849 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.642e-6■■□□□ 14.3
PABPC4Q13310 PSMD4-205ENST00000445776 703 ntTSL 321.07■□□□□ 0.965e-25■■□□□ 14.3
PABPC4Q13310 PSMD4-203ENST00000427779 649 ntTSL 320.95■□□□□ 0.945e-25■■□□□ 14.3
PABPC4Q13310 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.85e-25■■□□□ 14.3
PABPC4Q13310 PSMD4-202ENST00000368884 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.125e-25■■□□□ 14.3
PABPC4Q13310 PSMD4-206ENST00000453615 371 ntTSL 310.48□□□□□ -0.735e-25■■□□□ 14.3
PABPC4Q13310 UCK2-208ENST00000479872 4669 ntTSL 29.48□□□□□ -0.895e-6■■□□□ 14.3
PABPC4Q13310 RPL35A-203ENST00000439255 564 ntTSL 56.93□□□□□ -1.31e-39■■□□□ 14.3
PABPC4Q13310 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.234e-16■■□□□ 14.3
PABPC4Q13310 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.164e-16■■□□□ 14.3
PABPC4Q13310 UBA1-203ENST00000377351 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.754e-16■■□□□ 14.3
PABPC4Q13310 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.768e-11■■□□□ 14.3
PABPC4Q13310 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.018e-11■■□□□ 14.3
PABPC4Q13310 AP2M1-212ENST00000461733 1470 ntTSL 217.79■□□□□ 0.448e-11■■□□□ 14.3
PABPC4Q13310 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.158e-11■■□□□ 14.3
PABPC4Q13310 MZT2B-208ENST00000491178 234 ntTSL 319.73■□□□□ 0.757e-9■■□□□ 14.3
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PABPC4Q13310 RPL23-208ENST00000577760 3081 nt11.85□□□□□ -0.511e-85■■□□□ 14.3
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PABPC4Q13310 RPL26-212ENST00000584906 561 ntTSL 34.76□□□□□ -1.653e-8■■□□□ 14.3
PABPC4Q13310 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.475e-7■■□□□ 14.3
PABPC4Q13310 RPS28-202ENST00000449223 1523 ntTSL 222.13■■□□□ 1.138e-9■■□□□ 14.3
PABPC4Q13310 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.598e-9■■□□□ 14.3
PABPC4Q13310 RPS28-204ENST00000602140 912 ntTSL 1 (best)16.1■□□□□ 0.178e-9■■□□□ 14.3
PABPC4Q13310 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.618e-11■■□□□ 14.3
PABPC4Q13310 AGTRAP-214ENST00000514733 919 ntTSL 315.69■□□□□ 0.12e-6■■□□□ 14.3
PABPC4Q13310 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.383e-7■■□□□ 14.3
PABPC4Q13310 KRT19-204ENST00000468880 868 ntTSL 218.85■□□□□ 0.613e-7■■□□□ 14.3
PABPC4Q13310 LAMTOR4-212ENST00000494136 427 ntTSL 210.17□□□□□ -0.781e-8■■□□□ 14.3
PABPC4Q13310 KRTCAP2-203ENST00000463527 463 ntTSL 35.26□□□□□ -1.578e-15■■□□□ 14.3
PABPC4Q13310 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.644e-8■■□□□ 14.3
PABPC4Q13310 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.934e-8■■□□□ 14.3
PABPC4Q13310 RPL8-209ENST00000529920 876 ntTSL 220.37■□□□□ 0.859e-37■■□□□ 14.3
PABPC4Q13310 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.849e-37■■□□□ 14.3
PABPC4Q13310 RPL8-213ENST00000533397 730 ntTSL 219.84■□□□□ 0.779e-37■■□□□ 14.3
PABPC4Q13310 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.22e-9■■□□□ 14.3
PABPC4Q13310 WARS-202ENST00000355338 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.412e-9■■□□□ 14.3
PABPC4Q13310 WARS-201ENST00000344102 2690 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.572e-9■■□□□ 14.3
PABPC4Q13310 WARS-204ENST00000392882 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.92e-9■■□□□ 14.3
PABPC4Q13310 B2M-202ENST00000544417 933 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.181e-18■■□□□ 14.3
PABPC4Q13310 B2M-212ENST00000561424 604 ntTSL 311.38□□□□□ -0.591e-18■■□□□ 14.3
PABPC4Q13310 B2M-204ENST00000558401 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.651e-18■■□□□ 14.3
PABPC4Q13310 B2M-213ENST00000623550 2329 nt8.21□□□□□ -1.11e-18■■□□□ 14.3
PABPC4Q13310 B2M-201ENST00000349264 732 ntTSL 37.09□□□□□ -1.271e-18■■□□□ 14.3
PABPC4Q13310 B2M-211ENST00000561139 717 ntTSL 36.96□□□□□ -1.31e-18■■□□□ 14.3
PABPC4Q13310 B2M-205ENST00000559220 580 ntTSL 56.93□□□□□ -1.31e-18■■□□□ 14.3
PABPC4Q13310 SEPT5-207ENST00000431044 3173 ntTSL 1 (best)17.91■□□□□ 0.462e-7■■□□□ 14.3
PABPC4Q13310 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.216e-11■■□□□ 14.3
PABPC4Q13310 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.542e-7■■□□□ 14.3
PABPC4Q13310 LAMA5-212ENST00000495695 780 ntTSL 224.62■■□□□ 1.537e-8■■□□□ 14.3
PABPC4Q13310 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.89e-7■■□□□ 14.3
PABPC4Q13310 TIMM50-216ENST00000601358 1481 ntTSL 1 (best)25.53■■□□□ 1.689e-7■■□□□ 14.3
PABPC4Q13310 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.432e-10■■□□□ 14.3
PABPC4Q13310 MAP4-207ENST00000426837 8920 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.782e-10■■□□□ 14.3
PABPC4Q13310 FLNA-216ENST00000490936 5374 ntTSL 1 (best)17.38■□□□□ 0.371e-8■■□□□ 14.3
PABPC4Q13310 FLNA-203ENST00000369850 8382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.221e-8■■□□□ 14.3
PABPC4Q13310 BAX-212ENST00000515540 300 ntTSL 317.82■□□□□ 0.444e-6■■□□□ 14.3
PABPC4Q13310 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.793e-6■■□□□ 14.3
PABPC4Q13310 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.793e-6■■□□□ 14.3
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