Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms