Protein–RNA interactions for Protein: P36871

PGM1, Phosphoglucomutase-1, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGM1P36871 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PGM1P36871 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PGM1P36871 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PGM1P36871 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PGM1P36871 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PGM1P36871 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PGM1P36871 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PGM1P36871 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PGM1P36871 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PGM1P36871 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PGM1P36871 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PGM1P36871 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PGM1P36871 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PGM1P36871 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PGM1P36871 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PGM1P36871 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PGM1P36871 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PGM1P36871 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PGM1P36871 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PGM1P36871 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PGM1P36871 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PGM1P36871 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PGM1P36871 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PGM1P36871 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PGM1P36871 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PGM1P36871 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PGM1P36871 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PGM1P36871 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PGM1P36871 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PGM1P36871 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PGM1P36871 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PGM1P36871 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PGM1P36871 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PGM1P36871 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PGM1P36871 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PGM1P36871 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PGM1P36871 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PGM1P36871 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PGM1P36871 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PGM1P36871 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PGM1P36871 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PGM1P36871 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PGM1P36871 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PGM1P36871 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PGM1P36871 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PGM1P36871 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PGM1P36871 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PGM1P36871 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PGM1P36871 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PGM1P36871 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PGM1P36871 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PGM1P36871 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PGM1P36871 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PGM1P36871 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PGM1P36871 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PGM1P36871 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PGM1P36871 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PGM1P36871 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PGM1P36871 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PGM1P36871 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PGM1P36871 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PGM1P36871 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PGM1P36871 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PGM1P36871 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PGM1P36871 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PGM1P36871 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PGM1P36871 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PGM1P36871 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PGM1P36871 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PGM1P36871 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PGM1P36871 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PGM1P36871 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PGM1P36871 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PGM1P36871 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PGM1P36871 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PGM1P36871 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PGM1P36871 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PGM1P36871 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PGM1P36871 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PGM1P36871 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PGM1P36871 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PGM1P36871 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PGM1P36871 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PGM1P36871 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PGM1P36871 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PGM1P36871 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PGM1P36871 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PGM1P36871 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PGM1P36871 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PGM1P36871 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PGM1P36871 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PGM1P36871 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PGM1P36871 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PGM1P36871 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PGM1P36871 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PGM1P36871 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PGM1P36871 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PGM1P36871 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PGM1P36871 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PGM1P36871 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms