Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms