Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNPO3Q9Y5L0 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNPO3Q9Y5L0 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNPO3Q9Y5L0 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNPO3Q9Y5L0 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNPO3Q9Y5L0 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNPO3Q9Y5L0 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNPO3Q9Y5L0 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNPO3Q9Y5L0 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNPO3Q9Y5L0 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNPO3Q9Y5L0 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNPO3Q9Y5L0 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNPO3Q9Y5L0 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNPO3Q9Y5L0 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNPO3Q9Y5L0 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNPO3Q9Y5L0 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNPO3Q9Y5L0 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNPO3Q9Y5L0 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNPO3Q9Y5L0 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNPO3Q9Y5L0 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNPO3Q9Y5L0 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNPO3Q9Y5L0 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNPO3Q9Y5L0 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNPO3Q9Y5L0 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNPO3Q9Y5L0 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNPO3Q9Y5L0 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNPO3Q9Y5L0 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNPO3Q9Y5L0 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNPO3Q9Y5L0 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNPO3Q9Y5L0 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNPO3Q9Y5L0 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNPO3Q9Y5L0 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNPO3Q9Y5L0 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNPO3Q9Y5L0 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNPO3Q9Y5L0 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNPO3Q9Y5L0 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNPO3Q9Y5L0 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNPO3Q9Y5L0 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNPO3Q9Y5L0 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNPO3Q9Y5L0 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNPO3Q9Y5L0 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNPO3Q9Y5L0 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNPO3Q9Y5L0 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TNPO3Q9Y5L0 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNPO3Q9Y5L0 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNPO3Q9Y5L0 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNPO3Q9Y5L0 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNPO3Q9Y5L0 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNPO3Q9Y5L0 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNPO3Q9Y5L0 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNPO3Q9Y5L0 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNPO3Q9Y5L0 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNPO3Q9Y5L0 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNPO3Q9Y5L0 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TNPO3Q9Y5L0 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNPO3Q9Y5L0 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TNPO3Q9Y5L0 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNPO3Q9Y5L0 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNPO3Q9Y5L0 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNPO3Q9Y5L0 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNPO3Q9Y5L0 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TNPO3Q9Y5L0 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNPO3Q9Y5L0 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TNPO3Q9Y5L0 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNPO3Q9Y5L0 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNPO3Q9Y5L0 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TNPO3Q9Y5L0 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNPO3Q9Y5L0 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNPO3Q9Y5L0 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNPO3Q9Y5L0 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNPO3Q9Y5L0 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNPO3Q9Y5L0 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNPO3Q9Y5L0 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNPO3Q9Y5L0 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TNPO3Q9Y5L0 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNPO3Q9Y5L0 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNPO3Q9Y5L0 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNPO3Q9Y5L0 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNPO3Q9Y5L0 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNPO3Q9Y5L0 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNPO3Q9Y5L0 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNPO3Q9Y5L0 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNPO3Q9Y5L0 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNPO3Q9Y5L0 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNPO3Q9Y5L0 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNPO3Q9Y5L0 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNPO3Q9Y5L0 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNPO3Q9Y5L0 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNPO3Q9Y5L0 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TNPO3Q9Y5L0 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TNPO3Q9Y5L0 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TNPO3Q9Y5L0 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TNPO3Q9Y5L0 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms