Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms