Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms