Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms