Protein–RNA interactions for Protein: Q969G6

RFK, Riboflavin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFKQ969G6 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFKQ969G6 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms