Protein–RNA interactions for Protein: Q86WI1

PKHD1L1, Fibrocystin-L, humanhuman

Predictions only

Length 4,243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1L1Q86WI1 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKHD1L1Q86WI1 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKHD1L1Q86WI1 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKHD1L1Q86WI1 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKHD1L1Q86WI1 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKHD1L1Q86WI1 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKHD1L1Q86WI1 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKHD1L1Q86WI1 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKHD1L1Q86WI1 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
PKHD1L1Q86WI1 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKHD1L1Q86WI1 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKHD1L1Q86WI1 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
PKHD1L1Q86WI1 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKHD1L1Q86WI1 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKHD1L1Q86WI1 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
PKHD1L1Q86WI1 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKHD1L1Q86WI1 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKHD1L1Q86WI1 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKHD1L1Q86WI1 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKHD1L1Q86WI1 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms