Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms