Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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