Protein–RNA interactions for Protein: P25786

PSMA1, Proteasome subunit alpha type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA1P25786 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA1P25786 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms