Protein–RNA interactions for Protein: P17301

ITGA2, Integrin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA2P17301 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ITGA2P17301 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ITGA2P17301 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms