Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SFTPCP11686 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SFTPCP11686 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SFTPCP11686 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SFTPCP11686 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SFTPCP11686 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SFTPCP11686 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SFTPCP11686 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SFTPCP11686 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SFTPCP11686 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SFTPCP11686 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SFTPCP11686 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SFTPCP11686 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SFTPCP11686 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SFTPCP11686 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
SFTPCP11686 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
SFTPCP11686 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
SFTPCP11686 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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