Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms